Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。 （有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
在美丽的蔬果村里，各式各样的蔬菜和水果们幸福快乐地生活在那里，有柠檬太太、小柠檬、苹果老师、青蛙大夫、香蕉夫妇、胡萝卜警长、胡桃太太、南瓜先生、固执的胡桃刚克爷爷和和蔼的贝洛林村长等村民。而我们的主角就是聪明可爱的三人组，洋葱汤培、核桃柯露克和小花生佩可。 然而蔬果村的宁静却被大坏蛋黑蝙蝠、老鼠塔丘和鼹鼠毛毛一伙的到来而打破。黑蝙蝠和他的团伙们不断的盗取村子里的财物和食物，成为人人痛恨的大坏蛋。洋葱汤培、核桃柯露克和小花生佩可团结其他蔬果村的村民，勇敢地与黑蝙蝠和他的同伙们对抗。最终他们用团结、友爱和宽容，感化了黑蝙蝠一伙。蔬果村又恢复了往日的平静与祥和。
｢友達で終わるつもりだったけど…もう手加減しない｣野獣化した幼馴染と同棲!?迫られまくりの毎日は、ドキドキの連続で…!――高校進学を期に、日和は憧れの1人暮らしすることに。でも待っていたのは幼馴染の奏志とのルームシェア!?突然キスをされてとまどいを隠せない日和。からかっているの?それとも本気…? 15歳で同棲することになった日和の、過激な新生活が始まる!?
故事发生在美丽的不可思议星球上，这颗和平的星球上有七个国家，每一个国家各司其职，维系着这颗星球平稳的转动着。然而某一日，身为星球中心的太阳王国之中却发生了异常，这也就意味着，这颗星球在极短的时间内就将要崩溃。此时，法音（小岛惠美 配音）和莲音（后藤邑子 配音）两位太阳果的公主出现了，拯救了这次危机。 之后，两人离开了太阳星球，来到了皇家奇迹星球，在这里，树立着皇家奇迹学校，在这所学校里就读的，是来自与各国的公主与王子们，他们要在此取得成为皇后与国王的资格，方可毕业回国。学校里的课业紧张，竞争激烈，法音和莲音能否承受住压力，坚持到最后呢？
湘北高中的一年级新生樱木花道在初中就有了被50个女孩抛弃的“悲惨”经历，最后一个女孩抛弃他原来是看上了篮球部队小田，由此樱木对篮球更是深恶痛绝。进入高中后，樱木看上了美少女赤木晴子，晴子十分热爱篮球，为了赢取晴子的芳心，樱木决定加入篮球部。在侥幸赢得与篮球队队长赤木刚宪的打赌后，樱木顺利加入了篮球队。随着国中篮球联赛的最有价值球员流川枫的到来、伤愈复出的控位宫城良田以及误入歧途的前国中最有价值球员三井寿的回归，去年不堪一击的湘北篮球今年可谓人强马壮，虽然问题少年一大帮，但是在队长赤木刚宪的带领下，这一群以全国第一为目标的篮球少年正朝着自己的梦想进发！
距离极尽繁荣与荣华的人类文明迎来末日，已经经过了漫长的岁月。人类几乎死绝，就连生物都消失的迎来末日的世界。复杂建造的都市化作宛如迷宫的废墟，无从整备的机械也渐渐停止了动作。是何时结束的呢，是从何时开始结束的呢，就连这种想法也不复存在的终末世界中，有两位少女漫无目的地持续着旅行。千户与尤莉，今天也乘着爱车Kettenkrad，在废墟当中彷徨。 在终末世界中温暖地求生的反乌托邦幻想剧，就此开幕。
丸尾荣一郎是个认真务实的高中男学生，为解决课堂学习外运动不足的问题，偶然机会下参加了南网球俱乐部（STC）的免费体验活动，并在那里遇到了同校的女学生鹰崎奈津。在与鹰崎谈过并考量自己的兴趣后，决定加入STC，开始他打网球的生涯。 荣一郎把“只要能追上所有的球，并且能控制所有的球，理论上是不会输的。”这句话当信念，朝职网的目标努力中。
她是一个救世主，却又是一个普通的战斗机器人，可是身为战斗机器人的她，觉有着一颗美妙动人纯洁的心！这颗一切美妙动人纯洁的心，给我们带来了一个美妙动人纯洁的故事，让我融入其中，成为一片看不见的影子！这一切都是围绕着一个机器人麻幌和他的朋友或是说恋人美里优展开的！对于我，只是一个过客！ 麻幌是太白星最强的战士，她是个机器人，可她拥有一颗美妙动人纯洁的心。因为一次拯救世界的事件，她迫不得已的杀死了美里友的父亲，一位唯一理解她的人，从此开始了孤独与寂寞！正因为如此，她在即将消亡的时刻选择了报恩，来到了美里友的家里，做了他家的女佣，而失去父母的美里优，对这事情的一切都一无所知，只有对父母的思念和伤痛。 “麻幌，17岁，职业是女佣！”一位可爱伶俐的姐姐出现在绣球花绽放的庭院里，为了报恩，把最后的时光奉献给了美里优，而她自己，只有短短的398天生命了！但是她依然微笑，拼命的做家务，而她的心里，是如同海底石头一样孤独寂寞...... 最后，麻幌为了保护地球，死了！又留下了美里优一个人在忍受着寂寞的苦苦的等待她的回归。他又成了一个人，那悲伤从滚滚的海浪里涌来！ 苦苦的等待了二十年后，优已经忍受尽了人间悲伤，已经对孤独反感了，内心的孤独已经转变成了对所有事物的仇恨，他仇恨所有想破坏地球的机器人，成了一名机器人杀手。成为机器人杀手的他，已经对世界无情无意了，在一次任务中，他被人给刺杀，受重伤的时候，终于碰见了女神玛修为了他而留下一段回忆重生后麻幌（麻幌此时已经不是机器人了！），他苦苦等待二十年的人。美里优见到了麻幌，起初不相信，可是听到麻幌说：“我知道优是不会变的！”他终于发现，那是真的麻幌，他们一起回到了二十年前那绣球花绽放的庭院，抱在一起！
